Elliot, gündüzleri siber güvenlik mühendisi olarak çalışan, geceleri ise adeta bir kanun kaçağına dönüşen parlak ve içine kapanık bir genç programcıdır. Aynı zamanda, şizofreniye benzer tuhaf bir rahatsızlıkla da boğuşmaktadır. Bu durumunu kontrol altına almak için hem yasal hem de yasadışı ilaçlar alarak ve düzenli terapistiyle görüşerek çabalar. Bir gün, Darlene adında esrarengiz ve enerjik bir genç kadın ile kendisine Mr. Robot olarak tanıtan, yeraltı hacker grubu F-Society'nin gizemli lideri olduğunu iddia eden orta yaşlı bir adamla tanışır. Bu kişiler, Elliot'a adalet arayışını bir üst seviyeye taşıma ve çalıştığı fakat kötü olarak nitelendirdiği uluslararası finans şirketi E-Corp'u devirmelerine yardımcı olma fırsatını sunarlar. Elliot, bu teklifle kendini büyük bir yol ayrımında bulur. E-Corp'u hedef alan Mr. Robot, kişisel sebeplerle bu şirkete zarar vermek istemektedir. Ayrıca, Dark Army adıyla bilinen, daha gizemli ve tehlikeli bir hacker grubuyla da işbirliği yaptığını açıklar. Tüm bu karmaşanın içinde Elliot'un çocukluk arkadaşı Angela da vardır. E-Corp'u, ailesinin ölümünden sorumlu tuttuğu için şirketin bünyesine katılarak içeriden kanıt toplamaya ve yasal yollarla devirmeye çalışmaktadır. Bu planın beklenmedik bir diğer figürü ise, orijinal olarak İskandinavya'dan gelen ve egzantrik bir kişiliğe sahip psikopat E-Corp çalışanı Tyrell Wellick'tir. Tyrell'in, baskın ve hırslı eşi Joanna ile oldukça sıra dışı bir ilişkisi bulunmaktadır. Pek çok beklenmedik olay ve dönüşün ardından, Mr. Robot'un planı nihayet uygulamaya konur. Sonuçlar ise yıkıcı ve belki de beklenmeyen türdendir. Ancak bu, aslında hikayenin gerçek başlangıcının sadece sonudur. Film, izleyicilere gerilim, dram ve aksiyon dolu bir deneyim sunarken, karmaşık karakterler ve beklenmedik olay örgüsüyle de dikkat çekmektedir.