Philip Eberfrø isimli Danimarkalı bir iş adamı Tayland’da yeni fabrikasını ziyarete gider. Fabrikada çalışan çocuklardan birisi atkısını kullanarak yanlışlıkla damalı bir ninja bebek yapar. Bunun üzerine Eberfrø çocuğu döverek öldürür. Bir şimşek çakmasıyla Taiko Nakamura’nın ruhu ninja bebeğe gider. Ninja bebek Danimarkalı bir yük gemisine bindirilir ve yük gemisinde çalışan Stewart Stardust isimli adam bebeği bulur. Bebeği bulan Stardust, onu yeğeni Aske’ye doğum günü hediyesi olarak verir. Aske’nin arkadaşlarından birisi Glenn isimli bir zorbanın saldırısına uğrayınca ninja harekete geçer ve arkadaşını kurtarır. Aske, ninja bebeğin canlı olduğunu öğrenir ve aralarında bir arkadaşlık gelişir. Aske’ye yardım edeceğini ve karşılığında da Eberfrø’dan intikam için ninjaya yardım etmesini ister. İkili, birlikte bir maceraya atılır.