Uzak Ülke'nin Kralı Harold öldüğünde, Şrek, tahtın kesin varisi olur. Ancak Şrek, sevgili bataklığındaki hamile Fiona'ya geri dönebilmek için uzak bir krallıkta yasal varis olan Artie'yi bulmaya karar verir. Arkadaşları Eşek ve Çizmeli Kedi ile birlikte maceralı bir yolculuğa çıkar. Bu yolculuk sırasında, kıskanç ve hırslı Prens Yakışıklı, peri masallarının kötü adamlarına katılarak yeni kral olmak için bir darbe planlamaktadır. Şrek ve arkadaşları, Artie'yi bulmak için uzak krallığa doğru yola çıkarlar. Yolculukları sırasında karşılarına pek çok engel çıkar, ancak dostlukları ve kararlılıkları onları hedeflerine ulaştırır.