Yıl 2005. Autobots ve Decepticons arasındaki savaş, Decepticon'ların ele geçirdiği Cybertron ana gezegenleri üzerinde yoğunlaşmış durumda. Optimus Prime'ın hayatını kaybettiği Dünyadaki bir çatışmanın ardından, Autobots kendilerini hiç bilmedikleri bir kaderle yüz yüze bulur. Megatron ve bir grup terk edilmiş Decepticon, devasa bir gezegen tüketen şeytan olan Unicron tarafından daha ölümcül savaşçılar olarak yeniden biçimlendirilmiştir. Galvatron, Scourge ve Cyclonus, Unicron'un zaferi için Autobot Liderlik Matrisi'ni yok etmeli ya da Cybertron'un korkunç yıkımına tanık olmalıdır. Ancak, Optimus Prime, autobotlar arasından birisinin yükseleceğini ve Autobots'un en karanlık saatini aydınlatmak için Matrisin gücünü kullanacağını vasiyet etmiştir. Hot Rod, Prime'ın ölümünden dolayı kendini sorumlu hissederken, Matrisin gücünü kullanarak Cybertronian Savaşlarını kendi lehlerine çevirebileceğini ve Unicron'u durdurabileceğini düşünür. Tüm Autobots birleşene dek, hem Autobots'un hem de Decepticons'un geleceği belirsizliğini korur. Bu film, seyirciyi heyecan ve aksiyon dolu bir maceraya davet ediyor.